AHF a ouvert la première clinique AHF Uganda Cares dans le district de Masaka en février 2002 grâce à une collaboration avec le ministère ougandais de la Santé, offrant la toute première opportunité de traitement antirétroviral (TAR) en dehors de la capitale Kampala dans un établissement de santé publique – l’hôpital régional de référence de Masaka.

 AHF Uganda Cares est l'un des plus importants fournisseurs de services gratuits de lutte contre le VIH en Ouganda, proposant prévention, traitement et soins. Son modèle, qui intègre la participation du public, de la société civile et des communautés, a été reconnu comme une pratique exemplaire en matière de traitement antirétroviral par l'Organisation mondiale de la Santé et l'ONUSIDA en 2003. Grâce au soutien intensif des organisations communautaires, 98 % des patients suivent leur traitement. Au fil des ans, le programme s'est étendu à 28 districts, dont Rakai, où le premier cas de VIH en Ouganda a été identifié en 1980.

AHF Uganda Cares fournit gratuitement des traitements antirétroviraux à plus de 148 600 personnes à travers le pays, ainsi que des services ciblés de dépistage et de conseil du VIH afin d’atteindre les populations à risque et d’orienter les personnes séropositives vers les soins. Les actions de prévention comprennent l’éducation à l’utilisation du préservatif, la distribution gratuite de préservatifs et la promotion de pratiques sexuelles plus sûres par le biais de campagnes de sensibilisation et médiatiques.

Le dépistage du VIH est disponible dans les 64 établissements de santé soutenus par AHF, et des améliorations infrastructurelles ont été apportées afin d'offrir un environnement de soins respectueux de la dignité des patients. Par ailleurs, AHF Uganda Cares mène des actions de plaidoyer pour promouvoir l'accès aux traitements, obtenir des financements pour la lutte contre le VIH, protéger les droits des filles et promouvoir l'utilisation du préservatif comme méthode essentielle de prévention du VIH.