L’espoir d’un déclin progressif et d’une fin de la pandémie de COVID-19 aux États-Unis est anéanti par une recrudescence soudaine des infections et un système de surveillance épidémiologique déplorablement insuffisant. L’AIDS Healthcare Foundation exhorte le gouvernement américain à accélérer le séquençage génomique des tests positifs à la COVID-19 dans tout le pays et à élaborer un plan global et unifié pour un réseau de surveillance du virus performant.
Le nombre de nouveaux cas a augmenté de 129.3 % par rapport à son point le plus bas atteint le 20 juin 2021, selon Données du CDC sur une moyenne mobile sur sept jours des cas enregistrés. Le plus souche commune Le variant Delta, hautement contagieux, est le plus répandu du virus, mais les États-Unis accusent un retard par rapport aux autres pays développés en matière de suivi et d'identification des nouvelles souches. Selon les Initiative mondiale pour le partage de toutes les données sur la grippe (GISAID), depuis le début de 2020, les États-Unis n'ont séquencé et partagé les données génomiques que pour 1.89 % de tous les cas de COVID-19 signalés, tandis que le Royaume-Uni et l'Australie ont séquencé respectivement 10.5 % et 58.5 % des cas.
« Le SARS-CoV-2 est très sujet aux variations génétiques lorsqu'il se réplique et se propage au sein de différentes populations. Ces mutations donnent naissance à des variants plus résistants aux vaccins existants. C'est pourquoi un système robuste de séquençage génomique est absolument essentiel pour nous permettre de suivre l'évolution du virus et d'adapter nos traitements, nos stratégies de prévention et de diagnostic », a déclaré Dr Jorge Saavedra, directrice générale de l'Institut de santé publique mondiale de l'AHF à l'Université de Miami, qui est médecin et spécialiste des maladies infectieuses.
Une Histoire de Business Insider L’article, intitulé « Les États-Unis ne savent pas vraiment à quel point le variant Delta est répandu car leur séquençage viral est très en retard par rapport à de nombreux autres pays riches », a identifié plusieurs raisons à ces retards, principalement liées à une mosaïque d’approches en matière de séquençage génomique à travers le pays, notamment des défis logistiques et des contraintes réglementaires liées à la confidentialité des données des patients.
« Le gouvernement américain a alloué des milliards de dollars à la lutte contre la pandémie et le président Biden a invoqué… » Loi sur la production de défense « Pour accélérer l’accès aux diagnostics et aux technologies comme le séquençage génomique, le déploiement s’avère malheureusement lent, comme le suggèrent les données de GISAID », a ajouté le Dr Saavedra. « Forts de secteurs scientifiques et technologiques de pointe, les États-Unis devraient être à la pointe mondiale dans ce domaine et aider les autres pays à rattraper leur retard en matière de séquençage génomique. Surtout, nous avons besoin de toute urgence d’un plan d’action concret pour le séquençage génomique aux États-Unis, faute de quoi nous risquons de favoriser l’émergence de variants encore plus infectieux, ce qui pourrait compromettre la reprise. »
L’AHF a récemment lancé un programme de subventions pour soutenir l’intensification des efforts de séquençage génomique à travers le monde. Des programmes sont déjà en cours ou à différents stades de développement aux États-Unis, en Ouganda, au Kenya, au Brésil, au Mexique, en Jamaïque, à Trinité-et-Tobago, en Inde, en Ukraine, aux Philippines et en Thaïlande. Le gouvernement américain pourrait également soutenir les efforts de séquençage génomique à l’étranger, notamment dans les pays en développement, par le biais d’instruments de développement tels que le Fonds mondial de lutte contre le sida, la tuberculose et le paludisme. Cette approche serait mutuellement avantageuse pour les États-Unis et les autres nations, car la sécurité sanitaire mondiale dépend de la sécurité de tous les pays, et le séquençage génomique est essentiel à la solidarité sanitaire et à la sécurité mondiale.
